Het verhaal van de MT begon bijna 10 jaar geleden toen de top designers van Yamaha hun potloden scherpten om een van de belangrijkste nieuw modellen in de geschiedenis van Yamaha Motor  Co., Ltd te creëren. Dit mocht absoluut geen gewone motor ets worden. De opdracht was duidelijk: een radicaal nieuwe machine bouwen met een indrukwekkend koppel en een bijzonder wendbaar chassis die op geen enkel punt kon worden vergeleken met de gewone motor etsen. De rest is geschiedenis. Door alle conventies uit te dagen en door zich te inspireren op de unieke Japanse motorsubcultuur, is Yamaha erin geslaagd om een nieuw type van motorfiets te ontwikkelen. De eerste MT-09 was geïnspireerd op de Dark Side of Japan en was zo verschillend dat hij in geen enkele bestaande categorie kon worden geplaatst.